Mutacje Loss-of-Function w APOC3, trójglicerydach i chorobie wieńcowej AD 2

Kiedy przeprowadza się sekwencjonowanie w dużych populacjach, można zidentyfikować wystarczającą liczbę nośników mutacji, aby ocenić korelację genotypu z fenotypem. W szczególności korzystne jest zogniskowanie sekwencji na eksonach, elementach genomu, które kodują białka (wspólnie nazwane egzomem), 7,8, ponieważ mutacje w sekwencjach kodujących białka (np. Missense, nonsense lub mutacje w miejscu splicingu ) są najłatwiej interpretowane. Aby odpowiedzieć na dwa powyższe pytania, zsekwencjonowaliśmy egzaminy 3734 osób w Stanach Zjednoczonych, zidentyfikowaliśmy mutacje i przetestowaliśmy mutacje pod kątem asocjacji z poziomami triglicerydów w osoczu. Następnie zbadaliśmy, czy te same mutacje były związane z ryzykiem klinicznej choroby niedokrwiennej serca.
Metody
Projekt badania i nadzór
Badanie przeprowadzono w ramach projektu Exome Sequencing National Heart, Lung and Blood Institute (NHLBI) (https://esp.gs.washington.edu/drupal).9,10 Badanie zostało zaprojektowane przez trójglicerydów i Lipoproteiny o dużej gęstości (TG i HDL) grupy roboczej projektu sekwencjonowania Exome (patrz dodatek). Instytucjonalne rady recenzenckie w Broad Institute i wszystkich uczestniczących stronach zatwierdziły protokoły badań projektu NHLBI Exome Sequencing Project. Dwóch ostatnich autorów ręczy za dokładność i kompletność danych i wszystkich analiz.
Discovery Cohorts
Badana grupa projektu Exome Sequencing obejmuje zarejestrowanych w siedmiu grupach populacyjnych (ryzyko rozwoju miażdżycy we wspólnotach, 11 rozwoju ryzyka tętnic wieńcowych u młodych dorosłych, 12 badań dotyczących zdrowia układu sercowo-naczyniowego, 13 badań Framingham Heart, 14 badań Jackson Heart, 15 badań wieloetnicznych Badania nad miażdżycą, 16 i Inicjatywą Zdrowia Kobiet17) oraz uczestnikami badań nad wczesnym zawałem serca (zawał mięśnia sercowego18) (patrz tabela S1 w dodatkowym dodatku, dostępna w pełnym tekście niniejszego artykułu).
Wszyscy uczestnicy wyrazili zgodę na udział w badaniach genetycznych. Poziom cholesterolu całkowitego, cholesterolu HDL i triglicerydów mierzono na próbkach krwi żylnej na czczo, zgodnie ze standardowymi procedurami. Wartości cholesterolu o niskiej gęstości lipoprotein (LDL) obliczono zgodnie ze wzorem Friedewalda, z przypisaniem wartości brakującej osobom z poziomem triglicerydów wyższym niż 400 mg na decylitr (4,5 mmol na litr).
Sekwencjonowanie Exome
Sekwencjonowanie egzonu przeprowadzono na Uniwersytecie w Waszyngtonie lub w Broad Institute. Warianty sekwencji DNA zidentyfikowane w jednej z instytucji zostały następnie przesłane do University of Michigan, gdzie zostały poddane kontroli jakości i filtrowaniu w celu wykluczenia wariantów, które mogły być fałszywie dodatnimi wynikami
[podobne: adapalen, bombki styropianowe, prometazyna ]

Powiązane tematy z artykułem: adapalen bombki styropianowe prometazyna